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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00135 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  31 lines
  1. **************************************
  2. * Arginase and agmatinase signatures *
  3. **************************************
  4.  
  5. Arginase (EC 3.5.3.1)  catalyzes the  degradation of arginine to ornithine and
  6. urea.  The sequence of arginase from several eukaryotes and one prokaryote [1]
  7. indicates that this enzyme has been well conserved through evolution.
  8.  
  9. Agmatinase (EC 3.5.3.11) (agmatine ureohydrolase) is a prokaryotic enzyme that
  10. catalyzes the  hydrolysis  of  agmatine  into  putrescine and urea [2].  It is
  11. structurally related to arginase.
  12.  
  13. Arginase and  agmatinase  are  enzymes  of  about  300 amino-acid residues. We
  14. selected two conserved regions as signatures for these types of enzyme.
  15.  
  16. -Consensus pattern: [LIVMF]-G-G-D-H-x-[LIVM]-[STA]
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: budding yeast  mating factor alpha-
  19.  2.
  20.  
  21. -Consensus pattern: D-[LIVM]-D-x-[LIVM]-D-P-x(3)-P-x(2)-G-T-x(3)-G-G
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  24.  
  25. -Last update: October 1993 / Patterns and text revised.
  26.  
  27. [ 1] Schrell A., Alt-Moerbe J., Lanz T., Schroeder J.
  28.      Eur. J. Biochem. 184:635-641(1989).
  29. [ 2] Szumanski M.B.W., Boyle S.M.
  30.      J. Bacteriol. 172:538-547(1990).
  31.